《噬神者 3》故事敘述近未來神秘生命體「荒神」將一切事物捕食殆盡，世界面臨崩壞邊緣。在《噬神者 2》時間軸的十年之後，除了荒神之外，又出現了起因不明的災難「灰域」，漂浮於空氣中的灰域發生後會逐漸擴散，吞噬所有接觸到的物品並將一切化為灰燼，使人類陷入空前的危機。芬里爾無法抵抗灰域的侵襲，穩固的統治體制也逐漸崩壞……奮力求生的人類於是在各地設立地下據點「港灣」，並打造出專門對抗「灰域」的新型士兵「對抗適應型噬神者」（又稱 AGE），與席捲大地的威脅搏鬥。
《噬神者 3》身為動作遊戲的最大特色是高速戰鬥，由「斬擊」、「射擊」、「防禦」和「吞噬」4 大要素構成，切換這 4 種方式來攻擊是遊戲的最大特徵。
本作也收錄了新要素：吞噬敵人之後可以施展的解放技藝，可以在地上和空中施展設定的招式，構築有自己特色的獨特攻擊套路。
還加入展盾突進，可以面向敵人展開像是盾牌的突進手段，這是之前作品沒出現過的新方式。藉由展盾突進，可以貼近或逃離敵人，帶來更快的速度感。藉由新系統的展開全方位的空間運用。
還有「荒神」變得也會「捕食攻擊」！過去玩家扮演的噬神者可以藉由吞噬敵人，強化自身的能力。但本作中牠們也會「捕食」進入荒神解放狀態，例如荒神阿努比斯，會從 4 足變成 2 足行動，每種荒神都會有牠們的解放狀態。
